「FAQ」の版間の差分

2015年5月13日 (水) 02:31時点における版

ログインできません
- VPNの接続先は正しいですか？（最初の接続先は ovs.orion.ac.jpです）
- パスワードは正しいですか？
- UNIXログイン、シェルが有効になっていますか？（所内ユーザのみ・お問い合わせください）

コマンドが実行されません
- パス(path)が通っていますか？　"パスが通っている"とは
- SGEに渡すジョブファイル中では、何もかもフルパスで書いてみてください

反応が非常に遅いです
- 巨大な計算をSGE経由でなくそのまま実行していませんか？　バッチジョブ投入システム SunGridEngine を用いた計算機の利用
- ディスクがいっぱいか、誰かがCPU/メモリを専有しているかもしれません、ご連絡ください

メモリが不足しそうですが実行していいですか
- 実行するメモリ空き容量を指定したり、SGEが使用するメモリ量を指定したりしてください
  - qsubオプション -l h_vmem=8GB　SGEが使うメモリの大きさを指定（これを超えるとジョブは強制終了）
  - qsubオプション -l virtual_free=8GB　メモリの空きが指定分ある場合に実行（不足している場合はpending）

ジョブファイルをたくさん用意するのが面倒です
- 「アレイジョブ」機能を使えば幸せになれるかもしれません　並列計算の実行#.E3.82.A2.E3.83.AC.E3.82.A4.E3.82.B8.E3.83.A7.E3.83.96

ジョブがステータスEqwで止まってしまった
- とりあえず　qstat -j job_id | grep reason　など実行して理由を確認しましょう（データ読み書きのパスは正しいですか？）
- 理由が取り除けたら、qmod -cj job_id で再投入
- 取り除けないエラーなら　qdel job_id で削除して出直しましょう

コンパイラ古くない？
- bias4の、/opt/rh/devtoolset-2/root/usr/bin に gcc4.8.2 g++4.8.2 が入ってます。CC=/opt/rh/devtoolset-2/root/usr/bin/gcc とかでmakeしてね

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 *メモリが不足しそうですが実行していいですか
 **実行するメモリ空き容量を指定したり、SGEが使用するメモリ量を指定したりしてください
-***qsubオプション '''-l h_vmem 8GB'''　SGEが使うメモリの大きさを指定（これを超えるとジョブは強制終了）
+***qsubオプション '''-l h_vmem=8GB'''　SGEが使うメモリの大きさを指定（これを超えるとジョブは強制終了）
-***qsubオプション  '''-l virtual_free 8GB'''　メモリの空きが指定分ある場合に実行（不足している場合はpending）
+***qsubオプション  '''-l virtual_free=8GB'''　メモリの空きが指定分ある場合に実行（不足している場合はpending）
 *ジョブファイルをたくさん用意するのが面倒です