SGE用スクリプトファイルをPBS用に書き換える方法

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主なコマンド Common command

PBS commandSGE command
Job submissionqsub [scriptfile]qsub [scriptfile]
Job deletion qdel [job_id] qdel [job_id]
Job status (for user) qstat -u [username] qstat -u [username]
Extended job status qstat -f [job_id] qstat -f -j [job_id]
Hold a job temporarily qhold [job_id] qhold [job_id]
Release job hold qrls [job_id] qrls [job_id]
List of usable queues qstat -Q qconf -sql

リソース指定 Resource specifications 

PBS command SGE command
Queue #PBS -q [queue] #$ -q [queue]
Nodes #PBS -l nodes=[#] n/a
Processors #PBS -l ppn=[#] #$ -pe [pe_name] [#]
Wall clock limit #PBS -l walltime=[hh:mm:ss] #$ -l time=[hh:mm:ss]
Standard output file #PBS -o [file] #$ -o [path]
Standard error #PBS -e [file] #$ -e [path]
Copy environment #PBS -V #$ -V
Notification event #PBS -m abe #$ -m abe
Email address #PBS -M [email] #$ -M [email]
Job name #PBS -N [name] #$ -N [name]
Job restart #PBS -r [y|n] #$ -r [yes|no]
Move current directory n/a #$ -cwd
Node usage #PBS -l naccesspolicy=singlejob n/a
Memory requirement #PBS -l mem=XXXXmb #$ -mem [#]G