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**UNIXログイン、シェルが有効になっていますか?(所内ユーザのみ・お問い合わせください) | **UNIXログイン、シェルが有効になっていますか?(所内ユーザのみ・お問い合わせください) | ||
* | *コマンドが実行されません | ||
** | **パス(path)が通っていますか? [http://www.obenri.com/_operation/path_through.html "パスが通っている"とは] | ||
**SGEに渡すジョブファイル中では、'''何もかも'''フルパスで書いてみてください | |||
*もっと高度な並列化がしたいです | *もっと高度な並列化がしたいです | ||
** | **make PE などあります。お問い合わせください | ||
*core.NNNNN | *core.NNNNN ていうサイズの大きな覚えのないファイルがたくさんあります | ||
**消していただいてかまいません [http://ja.wikipedia.org/wiki/%E3%82%B3%E3%82%A2%E3%83%80%E3%83%B3%E3%83%97 コアダンプ] | **消していただいてかまいません [http://ja.wikipedia.org/wiki/%E3%82%B3%E3%82%A2%E3%83%80%E3%83%B3%E3%83%97 コアダンプ] | ||
*反応が非常に遅いです | *反応が非常に遅いです | ||
**巨大な計算をSGE経由でなくそのまま実行していませんか? [[ | **巨大な計算をSGE経由でなくそのまま実行していませんか? [[バッチジョブ投入システム SunGridEngine を用いた計算機の利用]] | ||
**ディスクがいっぱいか、誰かがCPU/メモリを専有しているかもしれません、ご連絡ください | **ディスクがいっぱいか、誰かがCPU/メモリを専有しているかもしれません、ご連絡ください | ||
*メモリが不足しそうですが実行していいですか | |||
**実行するメモリ空き容量を指定したり、SGEが使用するメモリ量を指定したりしてください | |||
***qsubオプション '''-l h_vmem=8G''' SGEが使うメモリの大きさを指定(これを超えるとジョブは強制終了) | |||
***qsubオプション '''-l virtual_free=8G''' メモリの空きが指定分ある場合に実行(不足している場合はpending) | |||
* | *ジョブファイルをたくさん用意するのが面倒です | ||
**「アレイジョブ」機能を使えば幸せになれるかもしれません [[並列計算の実行#.E3.82.A2.E3.83.AC.E3.82.A4.E3.82.B8.E3.83.A7.E3.83.96]] | |||
*ジョブがステータスEqwで止まってしまった | |||
**とりあえず qstat -j ''job_id'' | grep reason など実行して理由を確認しましょう(データ読み書きのパスは正しいですか?) | |||
**理由が取り除けたら、qmod -cj ''job_id'' で再投入 | |||
**取り除けないエラーなら qdel ''job_id'' で削除して出直しましょう | |||
*javaのバージョンが新しすぎて動きません | |||
**Trinity のことでしたらメールで一声おかけください、回避方法があります | |||
*データベース(RDBMS)が使いたいです | |||
**mysqlとpostgresqlを用意しています。お問い合わせください | |||
**virtuosoもあるよ | |||
*コンパイラ古くない? | |||
**魔法の一行コマンド: scl enable devtoolset-3 bash を実行してください。gcc4.9 が使えるようになります | |||
**bias4の、/opt/rh/devtoolset-2/root/usr/bin に gcc4.8.2 g++4.8.2 が入ってます。CC=/opt/rh/devtoolset-2/root/usr/bin/gcc とかでmakeしてもいいです | |||
*順次作成中 ご質問、お問い合わせ、不具合の連絡などは support@nibb.ac.jp(@を半角に) まで |
2016年7月22日 (金) 06:19時点における最新版
- ログインできません
- VPNの接続先は正しいですか?(最初の接続先は ovs.orion.ac.jpです)
- パスワードは正しいですか?
- UNIXログイン、シェルが有効になっていますか?(所内ユーザのみ・お問い合わせください)
- コマンドが実行されません
- パス(path)が通っていますか? "パスが通っている"とは
- SGEに渡すジョブファイル中では、何もかもフルパスで書いてみてください
- もっと高度な並列化がしたいです
- make PE などあります。お問い合わせください
- core.NNNNN ていうサイズの大きな覚えのないファイルがたくさんあります
- 消していただいてかまいません コアダンプ
- 反応が非常に遅いです
- 巨大な計算をSGE経由でなくそのまま実行していませんか? バッチジョブ投入システム SunGridEngine を用いた計算機の利用
- ディスクがいっぱいか、誰かがCPU/メモリを専有しているかもしれません、ご連絡ください
- メモリが不足しそうですが実行していいですか
- 実行するメモリ空き容量を指定したり、SGEが使用するメモリ量を指定したりしてください
- qsubオプション -l h_vmem=8G SGEが使うメモリの大きさを指定(これを超えるとジョブは強制終了)
- qsubオプション -l virtual_free=8G メモリの空きが指定分ある場合に実行(不足している場合はpending)
- 実行するメモリ空き容量を指定したり、SGEが使用するメモリ量を指定したりしてください
- ジョブファイルをたくさん用意するのが面倒です
- 「アレイジョブ」機能を使えば幸せになれるかもしれません 並列計算の実行#.E3.82.A2.E3.83.AC.E3.82.A4.E3.82.B8.E3.83.A7.E3.83.96
- ジョブがステータスEqwで止まってしまった
- とりあえず qstat -j job_id | grep reason など実行して理由を確認しましょう(データ読み書きのパスは正しいですか?)
- 理由が取り除けたら、qmod -cj job_id で再投入
- 取り除けないエラーなら qdel job_id で削除して出直しましょう
- javaのバージョンが新しすぎて動きません
- Trinity のことでしたらメールで一声おかけください、回避方法があります
- データベース(RDBMS)が使いたいです
- mysqlとpostgresqlを用意しています。お問い合わせください
- virtuosoもあるよ
- コンパイラ古くない?
- 魔法の一行コマンド: scl enable devtoolset-3 bash を実行してください。gcc4.9 が使えるようになります
- bias4の、/opt/rh/devtoolset-2/root/usr/bin に gcc4.8.2 g++4.8.2 が入ってます。CC=/opt/rh/devtoolset-2/root/usr/bin/gcc とかでmakeしてもいいです
- 順次作成中 ご質問、お問い合わせ、不具合の連絡などは support@nibb.ac.jp(@を半角に) まで