FAQ

提供:biaswiki
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  • ログインできません
    • VPNの接続先は正しいですか?(最初の接続先は ovs.orion.ac.jpです)
    • パスワードは正しいですか?
    • UNIXログイン、シェルが有効になっていますか?(所内ユーザのみ・お問い合わせください)
  • コマンドが実行されません
    • パス(path)が通っていますか? "パスが通っている"とは
    • SGEに渡すジョブファイル中では、何もかもフルパスで書いてみてください
  • もっと高度な並列化がしたいです
    • make PE などあります。お問い合わせください
  • core.NNNNN ていうサイズの大きな覚えのないファイルがたくさんあります
  • メモリが不足しそうですが実行していいですか
    • 実行するメモリ空き容量を指定したり、SGEが使用するメモリ量を指定したりしてください
      • qsubオプション -l h_vmem=8G SGEが使うメモリの大きさを指定(これを超えるとジョブは強制終了)
      • qsubオプション -l virtual_free=8G メモリの空きが指定分ある場合に実行(不足している場合はpending)
  • ジョブがステータスEqwで止まってしまった
    • とりあえず qstat -j job_id | grep reason など実行して理由を確認しましょう(データ読み書きのパスは正しいですか?)
    • 理由が取り除けたら、qmod -cj job_id で再投入
    • 取り除けないエラーなら qdel job_id で削除して出直しましょう
  • javaのバージョンが新しすぎて動きません
    • Trinity のことでしたらメールで一声おかけください、回避方法があります
  • データベース(RDBMS)が使いたいです
    • mysqlとpostgresqlを用意しています。お問い合わせください
    • virtuosoもあるよ
  • コンパイラ古くない?
    • 魔法の一行コマンド: scl enable devtoolset-3 bash を実行してください。gcc4.9 が使えるようになります
    • bias4の、/opt/rh/devtoolset-2/root/usr/bin に gcc4.8.2 g++4.8.2 が入ってます。CC=/opt/rh/devtoolset-2/root/usr/bin/gcc とかでmakeしてもいいです


  • 順次作成中 ご質問、お問い合わせ、不具合の連絡などは support@nibb.ac.jp(@を半角に) まで