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*メモリが不足しそうですが実行していいですか | *メモリが不足しそうですが実行していいですか | ||
**実行するメモリ空き容量を指定したり、SGEが使用するメモリ量を指定したりしてください | **実行するメモリ空き容量を指定したり、SGEが使用するメモリ量を指定したりしてください | ||
***qsubオプション '''-l h_vmem= | ***qsubオプション '''-l h_vmem=8G''' SGEが使うメモリの大きさを指定(これを超えるとジョブは強制終了) | ||
***qsubオプション '''-l virtual_free= | ***qsubオプション '''-l virtual_free=8G''' メモリの空きが指定分ある場合に実行(不足している場合はpending) | ||
*ジョブファイルをたくさん用意するのが面倒です | *ジョブファイルをたくさん用意するのが面倒です | ||
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*コンパイラ古くない? | *コンパイラ古くない? | ||
**bias4の、/opt/rh/devtoolset-2/root/usr/bin に gcc4.8.2 g++4.8.2 が入ってます。CC=/opt/rh/devtoolset-2/root/usr/bin/gcc | **魔法の一行コマンド: scl enable devtoolset-3 bash を実行してください。gcc4.9 が使えるようになります | ||
**bias4の、/opt/rh/devtoolset-2/root/usr/bin に gcc4.8.2 g++4.8.2 が入ってます。CC=/opt/rh/devtoolset-2/root/usr/bin/gcc とかでmakeしてもいいです | |||
*順次作成中 ご質問、お問い合わせ、不具合の連絡などは support@nibb.ac.jp(@を半角に) まで | *順次作成中 ご質問、お問い合わせ、不具合の連絡などは support@nibb.ac.jp(@を半角に) まで |
2016年7月22日 (金) 06:19時点における最新版
- ログインできません
- VPNの接続先は正しいですか?(最初の接続先は ovs.orion.ac.jpです)
- パスワードは正しいですか?
- UNIXログイン、シェルが有効になっていますか?(所内ユーザのみ・お問い合わせください)
- コマンドが実行されません
- パス(path)が通っていますか? "パスが通っている"とは
- SGEに渡すジョブファイル中では、何もかもフルパスで書いてみてください
- もっと高度な並列化がしたいです
- make PE などあります。お問い合わせください
- core.NNNNN ていうサイズの大きな覚えのないファイルがたくさんあります
- 消していただいてかまいません コアダンプ
- 反応が非常に遅いです
- 巨大な計算をSGE経由でなくそのまま実行していませんか? バッチジョブ投入システム SunGridEngine を用いた計算機の利用
- ディスクがいっぱいか、誰かがCPU/メモリを専有しているかもしれません、ご連絡ください
- メモリが不足しそうですが実行していいですか
- 実行するメモリ空き容量を指定したり、SGEが使用するメモリ量を指定したりしてください
- qsubオプション -l h_vmem=8G SGEが使うメモリの大きさを指定(これを超えるとジョブは強制終了)
- qsubオプション -l virtual_free=8G メモリの空きが指定分ある場合に実行(不足している場合はpending)
- 実行するメモリ空き容量を指定したり、SGEが使用するメモリ量を指定したりしてください
- ジョブファイルをたくさん用意するのが面倒です
- 「アレイジョブ」機能を使えば幸せになれるかもしれません 並列計算の実行#.E3.82.A2.E3.83.AC.E3.82.A4.E3.82.B8.E3.83.A7.E3.83.96
- ジョブがステータスEqwで止まってしまった
- とりあえず qstat -j job_id | grep reason など実行して理由を確認しましょう(データ読み書きのパスは正しいですか?)
- 理由が取り除けたら、qmod -cj job_id で再投入
- 取り除けないエラーなら qdel job_id で削除して出直しましょう
- javaのバージョンが新しすぎて動きません
- Trinity のことでしたらメールで一声おかけください、回避方法があります
- データベース(RDBMS)が使いたいです
- mysqlとpostgresqlを用意しています。お問い合わせください
- virtuosoもあるよ
- コンパイラ古くない?
- 魔法の一行コマンド: scl enable devtoolset-3 bash を実行してください。gcc4.9 が使えるようになります
- bias4の、/opt/rh/devtoolset-2/root/usr/bin に gcc4.8.2 g++4.8.2 が入ってます。CC=/opt/rh/devtoolset-2/root/usr/bin/gcc とかでmakeしてもいいです
- 順次作成中 ご質問、お問い合わせ、不具合の連絡などは support@nibb.ac.jp(@を半角に) まで