インストール済み分子生物学ソフトウェアの使い方

インストール済み分子生物学ソフトウェアの使い方

• インストール先は基本的に /bio/bin となります。ユーザはログイン時に自動でパスが通っていますのでどこからでも使えます。
• ソフトウェア にあって、パスが通っていないもの（which で見つからないもの）は、一度 module コマンドを使ってパスを通していただく必要があります。

Modules

• module コマンドで指定のソフトウェア環境を読み込むことができます
• ソフトウェアのバージョン違いを切り替えられます

コマンド	説明
module list	ロード済み module 一覧
module avail	使用可能な module 一覧
module show [module_file_name]	module の内容表示
module load [module_file_name]	module のロード
module unload [module_file_name]	module のアンロード
module switch [module_file_name1] [module_file_name2]	module の切り替え（module_file_name1→module_file_name2）

• Trinitirnaseq 2.3.2 を使う場合

$ module load Trinityrnaseq/2.3.2