「生物情報解析システム」の版間の差分
ナビゲーションに移動
検索に移動
編集の要約なし |
編集の要約なし |
||
| (同じ利用者による、間の43版が非表示) | |||
| 1行目: | 1行目: | ||
[[File:300logo246w.jpg|70px]]<big> | [[File:300logo246w.jpg|70px]]<big> 基礎生物学研究所 超階層生物学センター データ統合解析室 </big> | ||
== 概要 == | == 概要 == | ||
* | *生物情報解析システム Version5 は、2018年6月から運用中です。 | ||
**'''「共有メモリ型計算サーバ」メインメモリ | **'''「共有メモリ型計算サーバ」メインメモリ 3TB ''' （メモリが多く必要な解析に） | ||
**'''「分散処理用計算機クラスタ」800コア''' （CPUを沢山使って分散処理したい解析に） | **'''「分散処理用計算機クラスタ」800コア''' （CPUを沢山使って分散処理したい解析に） | ||
** | *追加の計算機 | ||
**'''「共有メモリ型計算サーバ」メインメモリ 4TB ''' | |||
**'''「共有メモリ型計算サーバ」メインメモリ 520GB 2台 ''' | |||
*基礎生物学研究所内の方はもちろん、所外の研究者の方にもお使いいただけます。[[ユーザーアカウントの取得方法]] | *基礎生物学研究所内の方はもちろん、所外の研究者の方にもお使いいただけます。[[ユーザーアカウントの取得方法]] | ||
*利用資格などは内規をご覧ください。 [[生物情報解析システム:利用内規]] | *利用資格などは内規をご覧ください。 [[生物情報解析システム:利用内規]] | ||
{{Note|実際の解析は「'''PBS'''」というジョブ管理システム経由で行います。「PBSの使い方」を一読ください。|warn}} | |||
== 停止予定 == | |||
[[Info|障害・停止情報]] | |||
== システム構成 == | == システム構成 == | ||
* [[マシン構成]] | * [[マシン構成]] | ||
* [[分子生物学データベース]] | * [[分子生物学データベース]] | ||
* [[ソフトウェア]] | * [[インストール済み分子生物学ソフトウェアの使い方|ソフトウェア]] | ||
== 利用手続き == | == 利用手続き == | ||
| 20行目: | 27行目: | ||
* [[ユーザーアカウントの取得方法]] | * [[ユーザーアカウントの取得方法]] | ||
* [[報告書提出のお願い（毎年度末）]] | * [[報告書提出のお願い（毎年度末）]] | ||
* [[利用を終了する場合]] | |||
* [[論文における謝辞の書き方]] | * [[論文における謝辞の書き方]] | ||
== 使い方 == | == 使い方 == | ||
*[[SGE用スクリプトファイルをPBS用に書き換える方法]] | |||
*[[ログイン]] | *[[ログイン]] | ||
*[[ローカルマシンからデータをコピーする]] | *[[ローカルマシンからデータをコピーする]] | ||
*[[インストール済み分子生物学ソフトウェアの使い方]] | *[[インストール済み分子生物学ソフトウェアの使い方]] | ||
*[[ジョブ管理システム | *[[ジョブ管理システム PBSを用いた計算機の利用]] | ||
*[[並列計算の実行]] | *[[並列計算の実行]] | ||
* [[一人あたり利用可能なディスク容量について]] | * [[一人あたり利用可能なディスク容量について]] | ||
*[[Tips & FAQ]] | *[[Tips & FAQ]] | ||
* [https://biaswiki.nibb.ac.jp/menu/index.php/利用講習会 利用講習会] | |||
2024年6月19日 (水) 10:50時点における最新版
基礎生物学研究所 超階層生物学センター データ統合解析室
概要
- 生物情報解析システム Version5 は、2018年6月から運用中です。
- 「共有メモリ型計算サーバ」メインメモリ 3TB （メモリが多く必要な解析に）
- 「分散処理用計算機クラスタ」800コア （CPUを沢山使って分散処理したい解析に）
- 追加の計算機
- 「共有メモリ型計算サーバ」メインメモリ 4TB
- 「共有メモリ型計算サーバ」メインメモリ 520GB 2台
- 基礎生物学研究所内の方はもちろん、所外の研究者の方にもお使いいただけます。ユーザーアカウントの取得方法
- 利用資格などは内規をご覧ください。 生物情報解析システム:利用内規
実際の解析は「PBS」というジョブ管理システム経由で行います。「PBSの使い方」を一読ください。