「生物情報解析システム」の版間の差分

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**bias4 にはログインできなくなり、「bias5.nibb.ac.jp」となります。
**bias4 にはログインできなくなり、「bias5.nibb.ac.jp」となります。
**分散処理システムのエンジンが、SunGridEngine (SGE) から '''PBS Pro''' へと変更になり、これまでの qsub用スクリプトファイルはそのままでは動かなくなります。詳細は下記をご覧ください。
**分散処理システムのエンジンが、SunGridEngine (SGE) から '''PBS Pro''' へと変更になり、これまでの qsub用スクリプトファイルはそのままでは動かなくなります。詳細は下記をご覧ください。
*[[SGE用スクリプトファイルをPBS用に書き換える方法]]
***[[SGE用スクリプトファイルをPBS用に書き換える方法]]
** cat キューは終了しました
** cat キューは終了しました



2018年6月25日 (月) 04:56時点における版

300logo246w.jpg 基礎生物学研究所 生物機能解析センター 情報管理解析室

重要なお知らせ

  • 2018年6月11日に、生物情報解析システム Version5 へと、更新されました
    • ホームディレクトリのデータは、6月7日の 書き込み分まで、新システムに引き継がれています
    • bias4 にはログインできなくなり、「bias5.nibb.ac.jp」となります。
    • 分散処理システムのエンジンが、SunGridEngine (SGE) から PBS Pro へと変更になり、これまでの qsub用スクリプトファイルはそのままでは動かなくなります。詳細は下記をご覧ください。
    • cat キューは終了しました

概要

  • 生物情報解析システム Version5 は、2018年6月から運用中です。
    • 「共有メモリ型計算サーバ」メインメモリ 3TB  (メモリが多く必要な解析に)
    • 「分散処理用計算機クラスタ」800コア (CPUを沢山使って分散処理したい解析に)
  • 基礎生物学研究所内の方はもちろん、所外の研究者の方にもお使いいただけます。ユーザーアカウントの取得方法
  • 利用資格などは内規をご覧ください。 生物情報解析システム:利用内規
  • 全てのアプリケーション、データベース/ホームディレクトリを含めた全てのディスク領域は、全計算機から同様に使うことができます。
  • システムをお使いいただくには「UNIXコマンドの知識」があることが前提になります。デスクトップ画面はありません。

障害・障害復旧情報

  • 現在大容量ストレージ上にある「~/save」領域が故障のため使えません。鋭意修復作業中です。ご迷惑をおかけして申し訳ありません(2017/04/26〜)

停止予定

  • 現在の停止予定はありません

システム構成

利用手続き

使い方

キュー利用状況

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