「Tips & FAQ」の版間の差分

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編集の要約なし
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*MPI関連のコマンドはどこにある?
*MPI関連のコマンドはどこにある?
**/usr/mpi/gcc/openmpi-3.1.0rc2/bin です コンパイラ:mpicc もここ
**<code>/usr/mpi/gcc/openmpi-3.1.0rc2/bin</code> です コンパイラ:mpicc もここ


*core.NNNNN ていうサイズの大きな覚えのないファイルがたくさんあります
*core.NNNNN ていうサイズの大きな覚えのないファイルがたくさんあります
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*ジョブがステータスEqwで止まってしまった
*ジョブがステータスEqwで止まってしまった
**とりあえず qstat -j ''your_job_id'' | grep reason など実行して理由を確認しましょう(データ読み書きのパスは正しいですか?)
**とりあえず <code>qstat -j ''your_job_id'' |   grep reason</code> など実行して理由を確認しましょう(データ読み書きのパスは正しいですか?)
**理由が取り除けたら、qmod -cj ''your_job_id'' で再投入
**理由が取り除けたら、<code>qmod -cj ''your_job_id'' </code>で再投入
**取り除けないエラーなら qdel ''your_job_id'' で削除して出直しましょう
**取り除けないエラーなら <code>qdel ''your_job_id'' </code>で削除して出直しましょう


*異常終了したのに eファイルとoファイルが作成されない
*異常終了したのに eファイルとoファイルが作成されない
**tracejob ''your_job_id'' で原因を探りましょう
**<code>tracejob ''your_job_id''</code> で原因を探りましょう
**わからない場合、そのジョブIDを support@nibb.ac.jp(@を半角に)までお知らせください
**わからない場合、そのジョブIDを support@nibb.ac.jp(@を半角に)までお知らせください


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**システムのjavaは触る予定がありませんので、お手数ですがホームディレクトリに最新版をインストールしてください
**システムのjavaは触る予定がありませんので、お手数ですがホームディレクトリに最新版をインストールしてください
**Linuxプラットフォーム用Javaの場合 [https://www.java.com/ja/download/help/linux_install.xml javaインストール方法]
**Linuxプラットフォーム用Javaの場合 [https://www.java.com/ja/download/help/linux_install.xml javaインストール方法]
** export PATH=/home/your_id/jdk1.8.0_91/bin:$PATH とパスを通します
**<code>export PATH=/home/your_id/jdk1.8.0_91/bin:$PATH</code> とパスを通します


*データベース(RDBMS)が使いたいです
*データベース(RDBMS)が使いたいです

2019年12月26日 (木) 06:53時点における版

  • ログインできません
    • VPNの接続先は正しいですか?(最初の接続先は ovs.orion.ac.jpです)
    • パスワードは正しいですか?
    • UNIXログイン、シェルが有効になっていますか?(所内ユーザのみ・お問い合わせください)
  • コマンドが実行されません
    • パス(path)が通っていますか? "パスが通っている"とは
    • PBSに渡すジョブファイル中では、何もかもフルパスで書いてみてください
  • MPI関連のコマンドはどこにある?
    • /usr/mpi/gcc/openmpi-3.1.0rc2/bin です コンパイラ:mpicc もここ
  • core.NNNNN ていうサイズの大きな覚えのないファイルがたくさんあります
  • メモリが不足しそうですが実行していいですか
    • よくはないが、利用メモリ量を推測することは難しい
    • 実行するメモリ空き容量を指定したり、PBSが使用するメモリ量を指定したりしてください
      • qsubオプション -l mem=8G PBSが使うメモリの大きさを指定(これを超えるとジョブは強制終了)
  • ジョブがステータスEqwで止まってしまった
    • とりあえず qstat -j your_job_id | grep reason など実行して理由を確認しましょう(データ読み書きのパスは正しいですか?)
    • 理由が取り除けたら、qmod -cj your_job_id で再投入
    • 取り除けないエラーなら qdel your_job_id で削除して出直しましょう
  • 異常終了したのに eファイルとoファイルが作成されない
    • tracejob your_job_id で原因を探りましょう
    • わからない場合、そのジョブIDを support@nibb.ac.jp(@を半角に)までお知らせください


  • javaのバージョンが古すぎて動きません
    • システムのjavaは触る予定がありませんので、お手数ですがホームディレクトリに最新版をインストールしてください
    • Linuxプラットフォーム用Javaの場合 javaインストール方法
    • export PATH=/home/your_id/jdk1.8.0_91/bin:$PATH とパスを通します
  • データベース(RDBMS)が使いたいです
    • mysqlとpostgresqlを用意しています。お問い合わせください
    • virtuosoもあるよ



  • 順次作成中 ご質問、お問い合わせ、不具合の連絡などは support@nibb.ac.jp(@を半角に) まで