「Tips & FAQ」の版間の差分

2021年6月18日 (金) 04:07時点における版

ログインできません
- VPNの接続先は正しいですか？（最初の接続先は pa-gate.orion.ac.jp (PaloAlto) または、ovs.orion.ac.jp (AnyConnect) です）
- ログインするマシン名は正しいですか？　bias5.nibb.ac.jp
- パスワードは正しいですか？
- UNIXログイン、シェルが有効になっていますか？（所内ユーザのみ・お問い合わせください）

反応が非常に遅いです
- 巨大な計算をPBS経由でなくそのまま実行していませんか？　ジョブ管理システム PBSを用いた計算機の利用
- ディスクがいっぱいか、誰かがCPU/メモリを専有しているかもしれません、ご連絡ください

プログラムが実行されません
- パス(path)が通っていますか？　"パスが通っている"とは
- PBSに渡すジョブファイル中では、何もかもフルパスで書いてみてください

メモリが不足しそうですが実行していいですか
- よくはないが、利用メモリ量を推測することは難しい
- メモリ制限についてもご覧ください
- qsubオプション #PBS -l mem=8G　PBSが使うメモリの大きさを指定できます（これを超えると、small, medium, large, blast キューのジョブは強制終了）

ジョブファイルをたくさん用意するのが面倒です
- 「アレイジョブ」機能を使えば幸せになれるかもしれません　並列計算の実行#.E3.82.A2.E3.83.AC.E3.82.A4.E3.82.B8.E3.83.A7.E3.83.96

ジョブがステータスEqwで止まってしまった
- とりあえず　qstat -j your_job_id　 | grep reason　など実行して理由を確認しましょう（データ読み書きのパスは正しいですか？）
- 理由が取り除けたら、qmod -cj your_job_idで再投入
- 取り除けないエラーなら　qdel your_job_idで削除して出直しましょう

異常終了したのに eファイルとoファイルが作成されない
- tracejob your_job_id で原因を探りましょう
- わからない場合、そのジョブIDを support＠nibb.ac.jp（＠を半角に）までお知らせください

リソースは空いているように見えるのにジョブがQ状態のまま実行されない
- tracejob your_job_id で原因を探ったら、隙間に滑り込めるように要求リソース量を調整しましょう
- 実はアレイジョブが占有しているかもしれません。　qstat -nr1t とすると畳まれていたアレイジョブが見えます

javaのバージョンが古すぎて動きません
- システムのjavaは触る予定がありませんので、お手数ですがホームディレクトリに最新版をインストールしてください
- Linuxプラットフォーム用Javaの場合 javaインストール方法
- export PATH=/home/your_account/jdk1.8.0_91/bin:$PATH　とパスを通します

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 *メモリが不足しそうですが実行していいですか
 **よくはないが、利用メモリ量を推測することは難しい
-**メモリ制限について[[]] もご覧ください
+**[[%E3%82%B8%E3%83%A7%E3%83%96%E7%AE%A1%E7%90%86%E3%82%B7%E3%82%B9%E3%83%86%E3%83%A0_PBS%E3%82%92%E7%94%A8%E3%81%84%E3%81%9F%E8%A8%88%E7%AE%97%E6%A9%9F%E3%81%AE%E5%88%A9%E7%94%A8#.E3.83.A1.E3.83.A2.E3.83.AA.E5.88.B6.E9.99.90.E3.81.AB.E3.81.A4.E3.81.84.E3.81.A6|メモリ制限について]] もご覧ください
 **qsubオプション <code>#PBS -l mem=8G</code>　PBSが使うメモリの大きさを指定できます（これを超えると、small, medium, large, blast キューのジョブは強制終了）