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*インストール済みソフトウェア(分子生物学) | *インストール済みソフトウェア(分子生物学) | ||
abyss [http://www.bcgsc.ca/platform/bioinfo/software/abyss] Assembly By Short Sequences - a de novo, parallel, paired-end sequence assembler | abyss [http://www.bcgsc.ca/platform/bioinfo/software/abyss] Assembly By Short Sequences - a de novo, parallel, paired-end sequence assembler | ||
allpaths-lg [http://www.broadinstitute.org/software/allpaths-lg/blog/] the new short read genome assembler from the Computational Research and Development group at the Broad Institute | |||
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2012年6月1日 (金) 01:27時点における版
- インストール済みソフトウェア(分子生物学)
abyss [1] Assembly By Short Sequences - a de novo, parallel, paired-end sequence assembler allpaths-lg [2] the new short read genome assembler from the Computational Research and Development group at the Broad Institute blast blast+ blat bowtie bwa-0.5.9 CAP3 cd-hit clustalw clustalw2 consed cufflinks dbget denovo2 EMBOSS fasta Gblocks genemark genscanlinux glimmer hmmer IGV lastz mafft meme mrbayes muscle njplot paup Phred+Phrap phylip phyml raxml readseq samtools soap sparsehash-1.11 stacks stacks-0.996 t_coffee tgicl_linux tophat tree-puzzle trinityrnaseq velvet
- インストール済みソフトウェア(その他)
Gene Spring (端末室 Windowsマシン上 所内のみ利用可) MATLAB(同上) MATLAB Distributed Computing Server Pipeline Pilot
- 他一般ソフトウェア、プログラム言語
csh tcsh zsh bash perl ruby python gcc gcc ver.4 icc