RCCS

提供:biaswiki
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計算科学研究センター(RCCS)への移行のためのページ

移行スケジュール

  • 2024年3月末 新規利用者募集終了
  • 2024年8月末 一般ユーザログイン終了
  • 2024年9月末 bias5運用終了

申請方法とユーザーアカウント

RCCS公式サイト: RCCS利用申請/利用報告に関する情報

  • 申請は「提案代表者」が研究グループ単位で行います。複数の研究グループメンバーを同時に申請できます。
  • 学部学生、日本非居住者、企業に属する方は利用できません。
  • 修士課程学生(6年制の5, 6学年含む)はメンバーになることができます
  • 申請には NOUSを利用します
    • 基生研HP内の申請システムNOUSの使い方・申請内容別記入例も参考にしてください
    • 最初の「Select the institute」 で必ず「IMS: 分子科学研究所 - IMS-RCCS-A-ja 分子科学研究所[IMS]計算科学研究センター施設利用(A)」を選ぶこと
    • bias5から継続利用される方は、各種区分では必ず「基礎生物学」を選ぶこと
  • 下記の「CPU点数について」も参照ください。

biasとrccsのシステムの違い

RCCS計算機利用の手引き
  • 基本は上記を参考にしてください
ログイン方法
  • sshの公開鍵認証を使用します。パスワードは使えません
分子生物学用アプリケーションとデータベース
  • 下記のコマンドで生物学解析実行用の設定を読み込みます。
source /apl/bio/etc/bio.sh
  • bias5と同様にmoduleコマンドが使えます
module avail
  • データベースへのパス:
/apl/bio/db
キューイング(ジョブ管理)システム
  • RCCSオリジナルのコマンドを利用します
キューについて
  • 1CPUあたりに使えるメモリ量が決まっています
  • 全体で使うメモリ量を指定することはできません。
  • 例)
CPU点数について
  • 利用できるリソースは「CPU点数制」になっています。