ソフトウェア

• インストール済みソフトウェア（分子生物学）

abyss [1] Assembly By Short Sequences - a de novo, parallel, paired-end sequence assembler
allpaths-lg [2]  The new short read genome assembler
blast The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) finds regions of	local similarity between sequences
blast+
blat
bowtie
bwa-0.5.9
CAP3
cd-hit
clustalw
clustalw2
consed
cufflinks
dbget
denovo2
EMBOSS
fasta
Gblocks
genemark
genscanlinux
glimmer
hmmer
IGV
lastz
mafft
meme
mrbayes
muscle
njplot
paup
Phred+Phrap
phylip
phyml
raxml
readseq
samtools
soap
sparsehash-1.11
stacks
stacks-0.996
t_coffee
tgicl_linux
tophat
tree-puzzle
trinityrnaseq
velvet

• インストール済みソフトウェア（その他）

Gene Spring （端末室 Windowsマシン上　所内のみ利用可）
MATLAB（同上）
MATLAB Distributed Computing Server
Pipeline Pilot

• 他一般ソフトウェア、プログラム言語

csh
tcsh
zsh
bash
perl
ruby
python
gcc
gcc ver.4
icc