Tips & FAQ

ログイン関連

• ログインできません
  • VPNの接続先は正しいですか？（最初の接続先は pa-gate.orion.ac.jp (PaloAlto) または、ovs.orion.ac.jp (AnyConnect) です）
  • ログインするマシン名は正しいですか？　bias5.nibb.ac.jp
  • パスワードは正しいですか？
  • UNIXログイン、シェルが有効になっていますか？（所内ユーザのみ・お問い合わせください）

ログインしてから

• 反応が非常に遅いです
  • 巨大な計算をPBS経由でなくそのまま実行していませんか？　ジョブ管理システム PBSを用いた計算機の利用
  • ディスクがいっぱいか、誰かがCPU/メモリを専有しているかもしれません、ご連絡ください

• core.NNNNN ていうサイズの大きな覚えのないファイルがたくさんあります
  • 消していただいてかまいません　コアダンプ

• MPI関連のプログラムはどこにある？
  • /usr/mpi/gcc/openmpi-3.1.0rc2/bin　です　コンパイラ：mpicc もここ

• データベース(RDBMS)が使いたいです
  • mysqlとpostgresqlを用意しています。お問い合わせください
  • virtuosoもあるよ

PBS関連

• プログラムが実行されません
  • パス(path)が通っていますか？　"パスが通っている"とは
  • PBSに渡すジョブファイル中では、何もかもフルパスで書いてみてください

• メモリが不足しそうですが実行していいですか
  • よくはないが、利用メモリ量を推測することは難しい
  • メモリ制限について もご覧ください
  • qsubオプション #PBS -l mem=8G　PBSが使うメモリの大きさを指定できます（これを超えると、small, medium, large, blast キューのジョブは強制終了）

• ジョブファイルをたくさん用意するのが面倒です
  • 「アレイジョブ」機能を使えば幸せになれるかもしれません　並列計算の実行#.E3.82.A2.E3.83.AC.E3.82.A4.E3.82.B8.E3.83.A7.E3.83.96

• ジョブがステータスEqwで止まってしまった
  • とりあえず　qstat -j your_job_id　 | grep reason　など実行して理由を確認しましょう（データ読み書きのパスは正しいですか？）
  • 理由が取り除けたら、qmod -cj your_job_idで再投入
  • 取り除けないエラーなら　qdel your_job_idで削除して出直しましょう

• 異常終了したのに eファイルとoファイルが作成されない
  • tracejob your_job_id で原因を探りましょう
  • わからない場合、そのジョブIDを support＠nibb.ac.jp（＠を半角に）までお知らせください

• リソースは空いているように見えるのにジョブがQ状態のまま実行されない
  • tracejob your_job_id で原因を探ったら、隙間に滑り込めるように要求リソース量を調整しましょう
  • 実はアレイジョブが占有しているかもしれません。　qstat -nr1t とすると畳まれていたアレイジョブが見えます

• javaのバージョンが古すぎて動きません
  • システムのjavaは触る予定がありませんので、お手数ですがホームディレクトリに最新版をインストールしてください
  • Linuxプラットフォーム用Javaの場合 javaインストール方法
  • export PATH=/home/your_account/jdk1.8.0_91/bin:$PATH　とパスを通します

• 順次作成中　ご質問、お問い合わせ、不具合の連絡などは support＠nibb.ac.jp（＠を半角に） まで