生物情報解析システム

基礎生物学研究所　生物機能解析センター　情報管理解析室

概要

生物情報解析システムは、下記から成る、生物学研究を支援する計算機システムです。

• 「共有メモリ型計算サーバ」メインメモリ 256GB 　（メモリが多く必要な解析に）
• 「分散処理用計算機クラスタ」256コア　（CPUを沢山使って分散処理したい解析に）
• さらに生物機能解析センター・共用計算機（次世代シーケンサdenovoアセンブリ用）として、メインメモリ 512GB、1TBを持つ計算機が提供されます。
  • 基礎生物学研究所内の方はもちろん、所外の研究者の方にもお使いいただけます。ユーザーアカウントの取得方法
  • 利用資格などは内規をご覧ください。　生物情報解析システム:利用内規
  • 全てのアプリケーション、データベース/ホームディレクトリを含めた全てのディスク領域は、全計算機から同様に使うことができます。
  • システムをお使いいただくには「UNIXコマンドの知識」があることが前提になります。デスクトップ画面はありません。
• システム構成
• 分子生物学データベース
• ソフトウェア

使い方

• ユーザーアカウントの取得方法
  • (1) ログイン
  • (2) 計算機の利用（バッチジョブ投入システム）
  • (3) SunGridEngineを使った並列計算

• 報告書提出のお願い（毎年度末）
• FAQ

NGS解析用ジョブ例を挙げてみよう

工事中