「生物情報解析システム」の版間の差分
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*さらに生物機能解析センター・共用計算機（次世代シーケンサdenovoアセンブリ用）として、メインメモリ 512GB、1TBを持つ計算機が提供されます。 | **さらに生物機能解析センター・共用計算機（次世代シーケンサdenovoアセンブリ用）として、メインメモリ 512GB、1TBを持つ計算機が提供されます。 | ||
***基礎生物学研究所内の方はもちろん、所外の研究者の方にもお使いいただけます。[[ユーザーアカウントの取得方法]] | ***基礎生物学研究所内の方はもちろん、所外の研究者の方にもお使いいただけます。[[ユーザーアカウントの取得方法]] | ||
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***全てのアプリケーション、データベース/ホームディレクトリを含めた全てのディスク領域は、'''全計算機から同様に'''使うことができます。 | ***全てのアプリケーション、データベース/ホームディレクトリを含めた全てのディスク領域は、'''全計算機から同様に'''使うことができます。 | ||
***システムをお使いいただくには「'''UNIXコマンドの知識'''」があることが前提になります。デスクトップ画面はありません。 | ***システムをお使いいただくには「'''UNIXコマンドの知識'''」があることが前提になります。デスクトップ画面はありません。 | ||
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2012年6月8日 (金) 07:24時点における版
基礎生物学研究所 生物機能解析センター 情報管理解析室
概要
- 生物情報解析システムは、下記から成る、生物学研究を支援する計算機システムです。
- 「共有メモリ型計算サーバ」メインメモリ 256GB （メモリが多く必要な解析に）
- 「分散処理用計算機クラスタ」256コア （CPUを沢山使って分散処理したい解析に）
- さらに生物機能解析センター・共用計算機（次世代シーケンサdenovoアセンブリ用）として、メインメモリ 512GB、1TBを持つ計算機が提供されます。
- 基礎生物学研究所内の方はもちろん、所外の研究者の方にもお使いいただけます。ユーザーアカウントの取得方法
- 利用資格などは内規をご覧ください。 生物情報解析システム:利用内規
- 全てのアプリケーション、データベース/ホームディレクトリを含めた全てのディスク領域は、全計算機から同様に使うことができます。
- システムをお使いいただくには「UNIXコマンドの知識」があることが前提になります。デスクトップ画面はありません。
システム構成
使い方
- ユーザーアカウントの取得方法
- (1) ログイン
- (2) 計算機の利用（バッチジョブ投入システム）
- (3) SunGridEngineを使った並列計算
NGS解析用ジョブ例を挙げてみよう
工事中