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2012年6月1日 (金) 01:21時点におけるCproom (トーク | 投稿記録)による版
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  • 分子生物学データベース
  • BLAST用データベースへのパス: /bio/db/blast/db
  • フラットファイルへのパス: /bio/db/ideas


名前説明フォーマット更新型
GenBank/GenBank-upd 核酸塩基配列フラット, DBGET 定期/日々
EMBL/EMBL-upd 核酸塩基配列フラット, DBGET 定期/日々
RefSeq/RefSeq-upd核酸塩基配列フラット, DBGET, FASTA, BLAST 定期/日々
EST_human/EST_mouse/EST_others 核酸塩基配列FASTA, BLAST 定期
NCBI nr-nt非冗長核酸塩基配列FASTA, BLAST 定期
gss 核酸塩基配列FASTA, BLAST 定期
HTGS核酸塩基配列FASTA, BLAST 定期
dbsts 核酸塩基配列FASTA, BLAST 定期
patnt 核酸塩基配列FASTA, BLAST 定期
env_nt核酸塩基配列FASTA, BLAST 定期
pdbnt 核酸塩基配列FASTA, BLAST 定期
NCBI nr-aa 非冗長アミノ酸配列FASTA, BLAST 定期
RefSeq-protein タンパク質アミノ酸配列フラット, DBGET, FASTA, BLAST 定期
UniProt(TrEMBL. Swissprot) タンパク質アミノ酸配列フラット, DBGET, FASTA, BLAST 日々
pataa タンパク質アミノ酸配列FASTA, BLAST 定期
env_nr タンパク質アミノ酸配列FASTA, BLAST 定期
pdbaa タンパク質アミノ酸配列FASTA, BLAST 定期
PDB タンパク質立体構造FASTA, BLAST 定期